AI助力“捞出”肠道菌群中耐药菌“杀手”

在人体的“宇宙”中，居住着数百万种微生物。它们相生相克、相互制衡，维持着人体健康的微生态平衡。

很多常见耐药菌，如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、大肠杆菌等都是人体共生的“原住民”。而人体中同样存在着克制它们的微生物及其代谢产物。找到这些耐药菌的“克星”作为药物是当前生命科学领域的前沿问题。

如何在数以千万亿计的人体微生物“居民”中“捞出”这些耐药菌的天然“杀手”呢？面对这一难题，中国科学院微生物研究所研究员陈义华和王军团队合作，利用机器学习的方法，从一万多个肠道微生物中“海淘”出3个具有显著活性和安全性的抗菌肽“潜力股”。相关研究3月4日发表于《自然—生物技术》。

“整个研究令人振奋！从人体肠道微生物组挖掘抗菌肽的方法十分新颖。”该刊一位审稿人评论说。

科学家认为，人体肠道中庞大的微生物“居民”中也蕴含着与耐药病原菌共生的克星，它们的代谢产物能够抑制耐药菌的活性。

抗菌肽（AMPs）就是这样一类具有抗微生物活性的小肽（序列在几个到几十个氨基酸残基之间）。以往研究发现，它们经过简单的后修饰或不经任何修饰就能直接发挥作用，达到抑制病原微生物的效果。它们能抵御多重耐药菌，同时不易产生耐药性的抗菌肽，被认为是可能替代传统抗生素的下一代抗菌剂。

◎ 来源|中国科學报